El INSUGEO fue organizado en la Universidad Nacional de Tucumán en 1984 con el objetivo de dar respuesta a temas de investigación geológico-regional, siendo incorporado al marco de unidades ejecutoras de CONICET en el año 1996. Actualmente integra el Centro Científico y Tecnológico (CCT-Tucumán). También mantiene estrecha colaboración en el ámbito de la investigación y gestión tecnológico-científica con el grupo vinculado de la Universidad Nacional de Salta (CEGA).

Los equipos de trabajo del INSUGEO se han nucleado alrededor de una serie de eje temáticos, que abarcan geología regional, petrografía, geoquímica, paleontología de invertebrados y vertebrados, sedimentología, icnología, estratigrafía dinámica e hidrogeología.

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